本书是为具有一定生物学基础的研究生编写的教材。本教材系统地阐述现代系统生物学的基本概念与研究方法，并教授学生联系实际进行科研实践。在介绍系统生物学原理与方法的基础上，分析学派间争论的焦点，探索其分歧的主要根源，并着重研究支序系统学的特征分析、系统发育关系重建等方法与技巧及其在生物多样性分析与保护、生物地理学、生态学、遗传育中学与寄生生物学等各种比较学科中应用。也希望进一步学会整合发生在生物不同层次中的理论、实验数据，并在整合的基础上提出能够刻画该系统不同层次的支序图或模型，用这种模型来预测系统未来可能发生的变化。本教材适用于生命学科、水产学科、地质、地理学科与环境学科的师生或科研人员学习、使用或参考。

**章 系统生物学与进化研究及其有关学科的关系
**节 系统生物学及其发展
第二节 关于生命起源的问题
第三节 动物进化的例证
第四节 进化原因的探讨——进化理论
第五节 动物进化规律和进化谱系
第六节 动物地理区划与海洋渔区划分
第七节 动物生态学与环境概要
复习题
参考文献
第二章 系统原理与生物系统
**节 系统原理
第二节 生物的一级分类系统
复习题
参考文献
第三章 系统生物学的发展与分支系统学
**节 系统生物学的发展
第二节 系统生物学内部学派的争论
第三节 分支系统学的原理与方法
第四节 特征分析
复习题
参考文献
第四章 物种概念与物种形成和保护
**节 物种概念
第二节 亚种分化
第三节 物种形成
第四节 物种的生殖属性和表型属性的关系
第五节 物种多样性保护的研��
第六节 物种濒危的等级
复习题
参考文献
第五章 支序系统学与生物地理学
**节 生物地理学的理论基础
第二节 生物地理学的重大变革
第三节 国内有关生物地理学的主要论述
复习题
参考文献
第六章 生物化学在系统生物学中的应用
**节 生物体内分子特征
第二节 关于核酸
第三节 关于蛋白质
第四节 关于其他成分
第五节 现代分子生物学技术在系统生物学中的应用
第六节 PCR介导的DNA序列系统动物学中的应用
附录I 常见动物的主要特征
附录Ⅱ常见植物的识别和鉴定
**节 常见孢子植物的识别和鉴定
第二节 常见种子植物的识别和鉴定