我要向全世界的神奇宝贝宣布！世界**的神奇宝贝专家……就是我！小智这样大声宣布着，他是来自真新镇的十岁少年，他正与*行得到的神奇宝贝——皮卡丘一同在修行的旅途中。途中他与原本是深灰训练馆馆主的小刚，以及同样在修行，非常喜欢水系神奇的、宝贝的小霞相遇，并且一起结伴继续朝着修行之旅迈进。
正当小智一行人在某个深山里迷路时，无意间发现了浅红训练馆。在宛如忍者屋的训练馆里，小智和使用毒系神奇宝贝的阿桔交过手手，赢得了胜利，第六个粉红徽章也终于到手了！
后来，他们遇见了传说中的迷你龙，又参加了神奇宝贝大赛跑的比赛，虽然卷入了一场场的麻烦之中，但小智一行人*后还是平安地离开了野生原野区，继续向单车路迈进……

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