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高通量DNA测序和基因组学新型技术
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高通量DNA测序和基因组学新型技术

  • 作者:(澳)米切尔森(Mitchelson K.R.)
  • 出版社:科学出版社
  • ISBN:9787030203465
  • 出版日期:2008年01月01日
  • 页数:381
  • 定价:¥98.00
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    内容提要
    三十年前,由Sanger和G订bert分别建立了DNA双脱氧测序和化学测序技术。现在DNA测序的规模逐渐扩大,从每天能读几千个碱基对序列的小规模测序,发展到如
    今每天能够进行成千上万个序列的**测定,成为数十亿美元的“产业”。世界上几个大的测序**建立了大规模的基因组测序平台,支持几乎所有大学和大型医院的DNA测序工作。国际生物信息学**拥有存储约一千五百万碱基对序列信息的能力,我们正处于一个“后基因组”时代。然而DNA测序在生命科学和医学的许多领域,仍然是一个主要的诊断和研究手段。这种强劲的需求,推动了新的测序技术的发展。这些新技术既不用电泳,也不用Sanger测序方法,而是通过DNA合成的方法进行测序,包括在固相表面上进行的多重平行测序反应,每一个循环的数据通过成像的方法获得。*近有一项由454生命科学和马普研究所制定的计划,使用合成法测序技术测定穴居人基因组,该计划显示了这些新的DNA测序技术在后基因组学研究中的强大作用。这将成为第二代全人类基因组项目,而且预计将进一步陕速提升我们对人类基因组生物学知识的认识,加深我们对人类遗传性疾病机制的了解。
    本书汇集了DNA测序技术的一些
    目录
    现有技术
    **章 概述:DNA测序技术进展
    1 引言
    1.1 超高通量测序能力的生物技术意义
    2 测序前沿技术
    2.1 毛细管电泳和Sanger测序法
    2.2 高通量毛细管微阵列测序
    2.3 染料和检测器
    2.4 微型芯片电泳
    2.5 基于微型毛细管芯片的毛细管电泳测序
    2.6 质谱测序
    3 固相阵列测序装置
    3.1 超敏感的检测器和测序仪
    3.2 合成测序
    3.3 DNA单分子测序
    3.4 杂交重组测序
    4 技术展望
    4.1 纳米孔膜
    4.2 DNA合成的直接电学检测
    5 基因组短片段测序应用
    5.1 基于重测序的基因分型
    5.1.1 polony基因分型
    5.1.2 焦磷酸测序的基因分型
    5.1.3 多态性比率测序
    5.1.4 BEAMing
    5.2 古生物基因组
    5.3 洞人基因组
    5.4 元基因组
    5.5 重复DNA序列的SAM测序
    5.6 转录组和表达RNA序列分析
    5.7 MPSS和基因组分析
    5.8 光学定位
    6 小结
    参考文献
    第二章 芯片毛细管电泳与系统遗传分析系统
    摘要
    1 引言
    1.1 各种基于芯片的毛细管电泳系统
    2 芯片设计和流体操作
    2.1 芯片设计
    2.2 流体操作
    3 材料和制作
    3.1 材料
    3.2 制作
    3.2.1 玻璃材料的制作步骤
    3.2.2 高分子材料的制作步骤
    4 检测
    4.1 光学检测
    4.1.1 激光诱导的荧光检测
    4.1.2 吸光度检测
    4.1.3 化学发光检测
    4.2 电化学检测
    4.2.1 电流检测
    4.2.2 电导检测
    4.2.3 电位检测
    4.3 质谱
    5 表面修饰
    5.1 动态包被
    5.1.1 玻璃/石英基片的包被
    5.1.2 PMMA基片的包被
    5.1.3 PDMS基片的包被
    5.2 **性包被
    5.2.1 玻璃/石英基片的**包被
    5.2.2 PMMA基片的**包被
    5.2.3 PDMS基片的**包被
    6 应用
    6.1 核酸分析
    6.1.1 筛分介质
    6.1.2 依大小排列DNA片段
    6.1.3 基因分型
    7 DNA测序
    ……
    第三章 应用MALDI-TOF质谱法比较序列分析——利用知己序列寻找新的序列
    第四章 基于核苷酸偶联染料的DNA测序进展
    合成测序技术平台
    第五章 454生命科学(454Lif Sciences)皮升级测序系统
    第六章 合成法DNA测序的集成系统
    单分子测序
    第七章 单分子荧光显微镜及其在基于循环合成的单分子测序中的应用
    第八章 基于单个DNA链的纳米级核苷酸序列快速测序
    第九章 全基因组水平的单分子测序系统
    序列验证和分析
    第十章 测序和诱导突变相结合有利于短读长获得全新***的DNA片段序列
    第十一章 基因组测序和拼接
    第十二章 具有高污染风险的样品——古DNA和环境DNA核酸序列信息的有效测定
    内容索引

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