本书主要按调查者的不同分为九个部分。
**部分是20世纪80年代南京市有关部门及个人的调查。如80年代前期，“南京大屠杀”编史、建馆、立碑办公室的调查（其调查资料主要收入《侵华日军南京大屠杀史料》一书，江苏古籍出版社1985年出版）；1984年前后，南京市雨花台区文物复查暨南京大屠杀受害者、幸存者、目击者普查办公室的调查；1984年，江浦县党史办的调查；80年代中期，徐志耕先生的调查
第二至第八部分则为20世纪90 年代至今，南京地区南京大学、南京师范大学、南京理工大学、河海大学、南京农业大学和南京航空航天大学等六所高校及退休教授费仲兴等所进行的社会调查。其中，中国青年报社记者戴袁支参与并主持了南京理工大学、南京农业大学和南京航空航天大学的调查。上述调查资料为本书主体部分，均为**手口述材料，也未公开出版过，具有极高的史料价值。
第九部分为新闻报刊对南京大屠杀幸存者的访问报道。

本册说明
上
一、80年代南京市有关部门及个人调查
（一）“南京大屠杀”编史、建馆、立碑办公室调查
（二）雨花台区文物复查暨南京大屠杀受害者、幸存者、目击者普查办公室调查
（三）江浦县党史办调查
（四）徐志耕调查
二、南京大学调查
（一）城区调查
（二）浦口调查
（三）六合调查
中
三、南京师范大学调查
（一）城区调查
��二）栖霞调查
（三）尧化门调查
（四）八卦洲调查
（五）迈皋桥调查
（六）汤山调查
四、南京理工大学调查
（一）栖霞调查
（二）汤山调查
（三）麒麟、龙潭、仙鹤门调查
五、河海大学调查
（一）板桥调查
（二）西善桥调查
（三）铁心桥调查
（四）江心洲调查
六、南京农业大学调查
（一）湖山村调查
（二）仙鹤门调查
（三）孟塘调查
七、南京航空航天大学调查
（一）淳化调查
（二）秣陵调查
（三）湖熟、上坊、上峰等地调查
下
八、南京汤山地区调查
（一）汤山镇调查
（二）上峰镇调查
（三）麒麟镇调查
（四）上坊镇调查
（五）句容及其他地区调查
九、新闻报刊的访问报道
（一）新闻媒体
（二）政协文史期刊