本卷对我国子囊菌门真菌中的肉座菌科进行了全面的形态学和系统分类研究，记录该科6属244种，其中包括木霉属211种；对科和属的国内外分类研究概况进行了评述，提供了每个种的形态描述、图示和必要的讨论、中国已知种的分属检索表以及部分属的分种检索表。上述类群主要为潮湿林区中植物残体、腐殖质层、土壤等基物中的腐生真菌，部分寄生于其他真菌的子实体上，部分为高等植物的内生菌。其中一些种具有分解几丁质和木质纤维素的能力，另一些可以促进植物生长。木霉属的少数种已被广泛用于农业植物病害的生物**。

引言
本卷涉及子囊菌门(Ascomycota)粪壳纲(Sordariomycetes)肉座菌目(Hypocreales)肉座菌科(Hypocreaceae)6 属真菌的中国已知物种。该科真菌以肉质的子实体为显著特征，子座形状、颜色和大小因种而异，扁平、垫状或棒状，白色、淡黄色、橙色、红色、红褐色或接近黑色，微小者宽度小于1 mm，大的宽度可达5 cm或者更大。子囊壳单生或聚生，表生于基物上，或者埋生、半埋生于肉质的子座或菌丝层中，颜色鲜艳或者暗淡。
它们多为植物残体、土壤、腐殖质层和潮湿环境下的腐生真菌，部分类群具有寄生性，其中包括对其他真菌的寄生能力，还有一些是植物内生菌。它们在自然界物质与能量循环过程中，起着不可或缺的作用。多数种类可进行人工培养，并在培养中产生无性阶段。木霉属(Trichoderma)和菌寄生属(Hypomyces)是该科中物种数量较多的两个属。
据报道，该科一株菌寄生属真菌 Hypomyces AL018 产生苝醌类化合物，可代替天然竹红菌，用于生物农药竹红菌素的生产，对其发酵工艺进行了研究，以利于保���天然竹红菌资源，保护环境，具有显著的经济效益和社会效益(卢明锋和张月杰2006)。另外一些种类能产生具有生物活性的物质，对细菌、真菌和病毒具有抗生作用，对植物生长有促进作用(Inbar et al. 1994; Yedidia et al. 2001; Degenkolb et al. 2008a; Mukherjee et al. 2012)。利用 Trichoderma“hazianum”T22 菌株注册并商业化生产的**个生物**制剂(Harman and Taylor 1988)，对引起多种农作物病害的病原真菌具有显著的**作用。在环境治理方面，木霉属真菌可降解或转化污水和淤泥中的有害物质(Molla et al. 2002)，并对部分杀虫剂造成的土壤污染有一定治理作用(Rigot and Matsumura 2002)。
材料和方法
本卷所涉及的物种，其子实体形态和解剖结构的描述除特别指出外，都是对我国材料进行观察的结果，描述所用的真菌组织名称遵照 Korf(1973)的定义，数据多来自子囊座和子囊壳中部纵切面的测量结果。对颜色的记载以水为浮载剂，真菌组织大小的测量以棉蓝乳酚油为浮载剂。
本卷仅提供了每个种的正确名称、基原异名以及我国文献中曾出现的异名，其他异名则视需要并根据对有关分类单元的了解予以列出。真菌学名的使用遵循现行的《国际真菌、藻类、植物命名法规》(International Code of Nomenclature for fungi， algae and plants)(McNeill et al. 2012)，属的名称采纳 Rossman等(2013)对生赤壳科、肉座菌科和丛赤壳科属名使用的建议，木霉属名称的使用多依据 Bissett等(2015)的建议。定名人的拼写则根据 Kirk和Ansell(1992)真菌名称定名人的标准缩写。中文名称主要依据《真菌名词及名称》(无名氏1976)和《孢子植物名词及名称》(郑儒永等1990)。
本卷提供了我国肉座菌科已知属的检索表。本卷包含的种绝大部分是笔者观察过的，少数确实为可靠的种因借不到模式标本或相关材料，则根据文献记载或其他作者对权威材料的描述予以承认，笔者未观察过的种、存疑种和应排除的种放在每个属的后面。根据现行的命名法规，一个真菌一个名称，Trichoderma 成为 Hypocrea 的正确属名；由于笔者未对权威材料进行观察，本卷涉及的少数种仍然沿用其有性阶段 Hypocrea 的属名，没有进行命名上的处理。
标本馆名称缩写遵照 Holmgren等(1990)所著《标本馆索引》(Index Herbariorum)一书的标准方式，该书中没有列出的标本馆(室)则由本卷作者予以缩写。本志中出现的标本馆及其缩写如下：中国科学院微生物研究所菌物标本馆，HMAS；中国科学院昆明植物研究所隐花植物标本馆，HKAS；台湾自然科学博物馆真菌标本馆，TNM；吉林农业大学菌物标本馆，HMJAU；广东省微生物研究所菌物标本馆，HMIGD。
我国已知的属和种都提供了中文名称和拉丁学名，我国未发现的分类单元一般只用拉丁学名。除引言外，在同一部分中，真菌科及科以上名称**次出现时拉、汉对照，省略定名人，再次出现时仅用中文名称；属和种的名称**次出现时拉、汉对照，并提供定名人；再次出现时，仅用拉丁学名，一般省略定名人。
每一个种在国内分布的排列顺序是根据2004年版《中国地图集》(杜秀荣和唐建军2004)，省内地名按汉语拼音字母顺序排列；各个种在世界分布的排列顺序为亚洲、欧洲、非洲、北美洲、南美洲、大洋洲，各个洲中的**按照英文名称的字母顺序排列。
绪论
形态
子座 子座是包裹或者环绕子囊壳的营养组织，由假薄壁组织、紧密交织的菌丝或薄壁丝组织等构成，是肉座菌科(Hypocreaceae)的重要分类特征。肉座菌科真菌通常产生分散或连片肉质子座(stroma)或者较薄的菌丝层(subiculum)。子座垫状、盘状、平铺或棒状，菌丝层多为淡色；子座大小因种而异，宽度为1 mm至5 cm，棒木霉(Trichoderma alutaceum Jaklitsch)的子座为棒状，高度可达6 cm；色彩丰富，白色、淡黄色、橙色、红褐色至红色等，罕见黑色，干标本的子座大多较新鲜材料的色暗。子座上表面、下表面、侧面和髓部的解剖结构不尽相同，因属、种而异，通常由角胞组织、球胞组织、表层组织和交错丝组织构成。在3% KOH水溶液中略变色或者不变色，木霉属(Trichoderma Pers.)少数种的子座和菌寄生属(Hypomyces Fr.)部分种的菌丝层在3% KOH水溶液中变为红色或者其他颜色。子座的表观特征、菌丝层的颜色、各个部位的组织类型以及它们在KOH水溶液中是否发生颜色改变是重要的分类依据。
子囊壳的组织结构 该科真菌具有丛赤壳型**体。子囊壳单室(uniloculate)，埋生或半埋生于子座或菌丝层中，多聚生，淡色至暗色，多颜色鲜艳，肉质，球形、卵球形、近球形、倒梨形至瓶状，孔口与子座表面平齐或者部分外露形成乳突；子囊壳壁由角胞组织、矩胞组织、表层组织或交错丝组织构成，在3% KOH水溶液中略变色或者不变色，同属中多数种的子囊壳壁解剖结构相似。
子囊 该科真菌的子囊为单囊壁，通过顶孔释放子囊孢子，近圆柱形、窄棒状至棒状，基部略窄，顶环不明显，子囊的形状与大小在种内相对稳定，通常具有8个子囊孢子，部分类群的子囊孢子在分隔处断裂形成16个分子囊孢子，在Melzer试剂中不变色。
子囊孢子 该科子囊孢子为椭圆形、纺锤形、腊肠形或近球形，两端一般对称，无色、淡黄色、淡粉色至略带绿色，偶尔褐色，表面平滑或具纹饰，附属物或有或无，具1个分隔或单细胞，部分类群如蛛网菌属(Arachnocrea Z. Moravec)、Trichoderma和原肉座菌属(Protocrea Petch)等的子囊孢子成熟时在分隔处断裂，形成单细胞的分子囊孢子(part-ascospore)，分子囊孢子单态型或二态型。子囊孢子断裂形成2个形状相似的分子囊孢子，称为单态型；断裂为2个形状不同的分子囊孢子，称为二态型，其中远基分子囊孢子的形状多为球形、近球形、椭球形或卵形，近基分子囊孢子的形状主要为椭球形、卵形、柱形、楔形或柠檬形。
侧丝 肉座菌科真菌具有丛赤壳型**体，侧丝由子囊壳顶部向下生长呈栅栏状，分布在子囊间，随子囊的成熟逐渐消解。
无性阶段 肉座菌科的无性阶段可在自然基物上产生，多数种可在人工培养基上生长，通常具有特异性的菌落、分生孢子梗及分生孢子，有些种在培养中形成特征性的不育结构，它们形态多样。例如，Hypomyces属无性阶段分生孢子梗的主要类型包括cladobotryum型、mycogone型、sepedonium型、stephanoma型、acremonium型、papulaspora型和verticillium型等，Sphaerostilbella属的为gliocladium型，Trichoderma属通常具有trichoderma型、acremonium型、gliocladium型、pachybasium型和verticillium型，Arachnocrea属的一般为verticillium型，而Protocrea属的则是acremonium型和verticillium型。本科还包括仅发现无性阶段的属，如Escovopsis J.J. Muchovej & Della Lucia、Escovopsioides H.C. Evans & J.O. Augustin和Verticimonosporium Matsush. 等。
营养方式 肉座菌科真菌生长在潮湿环境下的植物残体上或地表，多数种营腐生生活，少数营寄生生活，包括寄生在其他真菌上，具有重寄生性，如菌寄生属[Hypomyces (Fr.) Tul. & C. Tul.]，部分为植物内生菌。
分类研究进展
肉座菌科是肉座菌目(Hypocreales)中物种多样性比较丰富的类群(Kirk et al. 2008)，产生鲜明的肉质子座或者菌丝层，子囊壳埋生于子座或菌丝层中是该科成员的共性特征。子座的形状、颜色、大小，菌丝层的颜色，子囊壳的形态，子囊孢子形状、分隔数目、表面特征、附属物有无、是否形成分子囊孢子等是区分属和种的重要依据。
De Notaris于1844年建立了肉座菌科；1897年，Lindau 将其划分为6个亚科；1901年，Earle将上述亚科提升至科的等级(Rogerson 1970)。Seaver(1909a， 1909b)根据子座和子囊壳特征，将肉座菌目分为两科：丛赤壳科(Nectriaceae)和肉座菌科；其分类观点被Petch(1938)采纳。Munk(1957)和Dennis(1960)将上述两科纳入球壳菌目(Sphaeriales)。Miller(1949)、Bessy(1950)、Luttrell(1951)、Dingley(1951a， 1951b，1952，1953，1954)、von Arx和Müller(1954)、Müller和von Arx(1962)等学者采用广义的肉座菌科概念，其中涵盖了丛赤壳科。Boedijn(1964)和 Rifai(1969a)则将它们视为不同的科。Kreisel(1969)根据子囊壳的质地、颜色和侧丝着生方式等特征将肉座菌目划分为7个科，将肉座菌科和丛赤壳科视为独立的两个科。Rogerson(1970)**对肉座菌目进行全面系统的研究，认为肉座菌目仅包括一个科，即肉座菌科；将该目所有属和种都纳入了肉座菌科，提供了分属检索表，明确了每个属的概念及其模式种。Rossman等(1999)认为，肉座菌目包括5个科，并对其中的生赤壳科(Bionectriaceae)、肉座菌科和丛赤壳科进行了世界专著性研究，建立了比较清晰的肉座菌科概念，他们的工作可视为肉座菌科研究的一个新起点。*近的研究表明，肉座菌目至少包括12个科(Zhuang and Zeng 2017)，Trichoderma 和 Hypomyces (Fr.) Tul. & C. Tul. 是其中物种数量较多的两个属，也是学者们研究较多的类群。
综上所述，肉座菌科的概念经历了从广义向狭义转变的过程。Rossman等(1999)采纳了狭义科的概念，包括12个属；随后的研究将其中4个属列为异名(Chamberlain et al. 2004；Jaklitsch et al. 2014；Jaklitsch and Voglmayr 2015；Zen

目录 序 中国孢子植物志总序 《中国真菌志》序 致谢 引言 1 材料和方法 1 绪论 3 形态 3 分类研究进展 4 肉座菌科分子系统学研究简况 5 中国肉座菌科分类研究 6 专论 9 肉座菌科HYPOCREACEAE De Not. 9 蛛网菌属 Arachnocrea Z. Moravec 9 笔者未观察的种 10 糙孢蛛网菌Arachnocrea scabrida Yoshim. Doi 10 类肉座菌属 Hypocreopsis P. Karst. 10 地衣状类肉座菌Hypocreopsis lichenoides (Tode) Seaver 10 应排除的种 11 Hypocreopsis phyllostachydis (Syd. & P. Syd.) I. Miyake & Hara 11 菌寄生属 Hypomyces (Fr.) Tul. & C. Tul. 11 鹅膏菌寄生Hypomyces amaniticola Z.Q. Zeng & W.Y. Zhuang 13 亚美尼亚菌寄生Hypomyces armeniacus Tul. & C. Tul. 14 金黄菌寄生Hypomyces aurantius (Pers.) Tul. & C. Tul. 14 黄褐菌寄生Hypomyces cervinus Tul. & C. Tul. 15 绿黄菌寄生Hypomyces chlorinigenus Rogerson & Samuels 16 金孢菌寄生Hypomyces chrysospermus Tul. & C. Tul. 17 拟完整菌寄生Hypomyces completiopsis Z.Q. Zeng & W.Y. Zhuang 18 湖北菌寄生Hypomyces hubeiensis Z.Q. Zeng & W.Y. Zhuang 19 歪孢菌寄生Hypomyces hyalinus (Schwein.) Tul. & C. Tul. 19 砖红菌寄生Hypomyces lateritius (Fr.) Tul. & C. Tul. 20 黄绿菌寄生Hypomyces luteovirens (Fr.) Tul. & C. Tul. 20 大孢菌寄生Hypomyces macrosporus Seaver 21 小孢菌寄生Hypomyces microspermus Rogerson & Samuels 21 真菌菌寄生Hypomyces mycophilus Rogerson & Samuels 22 直孢菌寄生Hypomyces orthosporus K. Pldmaa 23 粉红菌寄生Hypomyces rosellus (Alb. & Schwein.) Tul. & C. Tul. 24 枝葡孢菌寄生Hypomyces sibirinae Rogerson & Samuels 24 中国菌寄生Hypomyces sinicus W.Y. Zhuang， Shuang L. Chen， Z.Q. Zeng & H.D. Zheng 25 盘菌菌寄生Hypomyces stephanomatis Rogerson & Samuels 26 丝层菌寄生Hypomyces subiculosus (Berk. & M.A. Curtis) Hhn. 26 琥珀色菌寄生Hypomyces succineus Rogerson & Samuels 27 侧毛斑菌寄生Hypomyces tegillum Berk. & M.A. Curtis 27 三隔孢菌寄生Hypomyces triseptatus Rossman & Rogerson 28 云南菌寄生Hypomyces yunnanensis Z.Q. Zeng & W.Y. Zhuang 28 笔者未观察的种 29 丝葚霉菌寄生Hypomyces papulasporae Rogerson & Samuels 29 有害菌寄生Hypomyces perniciosus Magnus 29 多孔菌菌寄生Hypomyces polyporinus Peck 30 弯孢菌寄生Hypomyces semicircularis (G.R.W. Arnold， R. Kirschner & Chee J. Chen) R. Kirschner 30 托氏菌寄生Hypomyces tulasneanus Plowr. 30 应排除的种 31 Hypomyces aureonitens Tul. & C. Tul. 31 Hypomyces ipomoeae (Halst.) Wollenw. 31 Hypomyces lactifluorum (Schwein.) Tul. & C. Tul. 31 原肉座菌属 Protocrea Petch 31 原肉座菌Protocrea farinosa (Berk. & Broome) Petch 32 球束梗孢属Sphaerostilbella (Henn.) Sacc. & D. Sacc. 33 笔者未观察的种 33 黄球束梗孢Sphaerostilbella aureonitens (Tul. & C. Tul.) Seifert 33 木霉属Trichoderma Pers. 33 枝顶孢状木霉Trichoderma acremonioides Y.B. Zhang & W.Y. Zhuang 39 适应木霉Trichoderma adaptatum K. Chen & W.Y. Zhuang 40 非洲哈茨木霉Trichoderma afroharzianum P. Chaverri， F.B. Rocha， Degenkolb & Druzhin 41 聚集木霉Trichoderma aggregatum K. Chen & W.Y. Zhuang 41 拟淡黄木霉Trichoderma albofulvopsis W.T. Qin & W.Y. Zhuang 42 白绿木霉Trichoderma alboviride K. Chen & W.Y. Zhuang 43 桤木木霉Trichoderma alni Jaklitsch 43 山地木霉Trichoderma alpinum K. Chen & W.Y. Zhuang 44 棒木霉Trichoderma alutaceum Jaklitsch 45 窄梗木霉Trichoderma angustum W.T. Qin & W.Y. Zhuang 46 阿帕拉契木霉Trichoderma appalachiense Samuels & Jaklitsch 47 扁平木霉Trichoderma applanatum Z.X. Zhu & W.Y. Zhuang 47 类棘孢木霉Trichoderma asperelloides Samuels 48 星孔木霉Trichoderma asterineum W.T. Qin & W.Y. Zhuang 49 深褐木霉Trichoderma atrobrunneum F.B. Rocha， P. Chaverri & W. Jaklitsch 50 深绿木霉Trichoderma atroviride P. Karst. 51 平展橙红木霉Trichoderma aurantioeffusum Jaklitsch 54 网孢肉座菌Hypocrea aurantia Henn. 55 黄绿木霉Trichoderma aureoviride Rifai 55 奥地利木霉Trichoderma austriacum Jaklitsch 56 版纳木霉Trichoderma bannaense K. Chen & W.Y. Zhuang 57 须木霉Trichoderma barbatum Samuels 57 北京木霉Trichoderma beijingense K. Chen & W.Y. Zhuang 58 二叉木霉Trichoderma bifurcatum K. Chen & W.Y. Zhuang 59 波密木霉Trichoderma bomiense Y.B. Zhang & W.Y. Zhuang 59 短梗木霉Trichoderma breve K. Chen & W.Y. Zhuang 60 短致木霉Trichoderma brevicompactum G.F. Kraus， C.P. Kubicek & W. Gams 61 短粗木霉Trichoderma brevicrassum K. Chen & W.Y. Zhuang 62 英丹木霉Trichoderma britdaniae (Jaklitsch & Voglmayr) Jaklitsch & Voglmayr 62 棉絮状木霉Trichoderma byssinum K. Chen & W.Y. Zhuang 63 蓝木霉Trichoderma caerulescens (Jaklitsch & Voglmayr) Jaklitsch & Voglmayr 64 毛细木霉Trichoderma capillare Samuels & C.P. Kubicek 65 低头木霉Trichoderma catoptron P. Chaverri & Samuels 65 华中木霉Trichoderma centrosinicum W.T. Qin & W.Y. Zhuang 66 脆弱木霉Trichoderma ceramicum P. Chaverri & Samuels 67 蜡素木霉Trichoderma cerinum Bissett， C.P. Kubicek & Szakács 68 长白山木霉Trichoderma changbaiense K. Chen & W.Y. Zhuang 68 厚垣孢木霉Trichoderma chlamydosporum K. Chen & W.Y. Zhuang 69 色精木霉Trichoderma chromospermum P. Chaverri & Samuels 70 肉桂色木霉Trichoderma cinnamomeum P. Chaverri & Samuels 71 淡黄木霉Trichoderma citrinellum (Ellis) W.Y. Zhuang & Z.Q. Zeng 72 橘绿木霉Trichoderm