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生物芯片技术与应用详解
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生物芯片技术与应用详解

  • 作者:G.哈德曼
  • 出版社:化学工业出版社
  • ISBN:9787502589196
  • 出版日期:2006年09月01日
  • 页数:236
  • 定价:¥38.00
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    内容提要
    *近几年应用生物芯片技术进行基因表达谱分析已成为常用的分子生物学技术。全基因组序列信息的公布和技术的进步,促使生物芯片技术能在基因组等更广范围上进行应用,使分析生物转录组中大部分基因的表达谱成为可能。记得当我**次看到真实的芯片时是如此的激动。这是发生在1995年,Synteni公司在Palo Alto的DNAX**演示生物芯片技术,我当时是一名博士后。1998年,作为在上游技术领域的科研人员,我终于有机会成为这一研究领域中的一员。那时,DNA微阵列技术已发展得相当成熟,芯片制备技术和数据分析方法也变得更复杂。写作本书的动机源于2002年3月由我在加利福尼亚大学San Diego Bioscience Extension组织的一门称为“微阵列技术总论”的课程。这提供了一个重要的论坛来探讨生物芯片技术的*新进展和发展趋势。该课程提供了微阵列和基因芯片技术的详细介绍,不断发展的生物芯片研究、微流路技术、设备、点印和检测方法以及成功进行基因表达谱和SNP分析所需方法和试剂等的技术标准。这已成为年度大事,并出版了2003年度会议总结。
    本书是一部指导生物芯片研究人员进行实验室操作的技术手册
    目录
    1生物芯片技术简介陈忠斌王艳华译1
    11引言2
    12DNA微阵列芯片的发展过程2
    13DNA微阵列和基因芯片3
    14基于启动子的DNA微阵列芯片5
    15生物芯片操作中遇到的问题6
    16芯片检测方法6
    17结论7
    参考文献7
    2微阵列生物芯片操作的实验室自动化马卓娅汤华译9
    21为什么要实现实验室的自动化操作?10
    22定制微阵列芯片的制作10
    23杂交系统的自动化13
    24芯片数据的读取——扫描仪13
    25实验室的常规自动化16
    26总结18
    参考文献18
    3DNA芯片与生物芯片**实验室刘全俊潘品良译19
    31引言20
    32点样芯片——寡核苷酸或PCR扩增子?21
    33DNA的高通量扩增21
    34小鼠单基因微阵列的制备25
    35RNA的确定和荧光靶标的标记26
    36标记靶标的评价28
    37微阵列芯片的预扫描28
    38杂交和扫描29
    39点制芯片的质量控制30
    310芯片点样仪和扫描仪31
    311数据分析——克隆跟踪、芯片寻点(spotfinding)以及数据发掘32
    312结论35
    参考文献39
    4生物芯片的纳米颗粒标记刘全俊陆祖宏潘品良译40
    41引言41
    42RLS粒子作为超灵敏检测标记物的基本原理41
    43光散射理论和选择便于超灵敏检测的颗粒大小组分42
    44仪器50
    45蛋白质、DNA探针及配体与RSL颗粒的交联51
    46RLS颗粒在固相检测分析中的检测灵敏度和检测范围51
    47应用52
    致谢58
    参考文献59
    5如何评估生物芯片扫描仪潘品良刘全俊译60
    51引言61
    52扫描仪的校准61
    53总结67
    参考文献69
    6全基因组水平mRNA表达谱分析在农业基因组学研究中的
    应用周鑫徐文英译70
    61引言71
    62基因转录谱分析芯片72
    63对未测序植物的可选方法73
    64农业研究中的应用范围73
    65整合互补的基因组数据74
    66结论75
    参考文献76
    7生物芯片技术在**靶标确证和新药发现中的应用文思远王升启译80
    71基因组学和**发现81
    72单核苷酸多态性和Crohn病82
    73微阵列技术和精神分裂症83
    参考文献85
    8蛋白质芯片在蛋白质组学中的应用周华蕾马玉媛吕茂民译
    章金刚校87
    81引言88
    82芯片构造与表面化学88
    83结合蛋白的检测91
    84蛋白质芯片的应用93
    85结论94
    致谢94
    参考文献95
    9SpanscriptTM:快速获取非冗余cDNA3′端文库用于制备微阵列芯片的
    方法仇华吉刘丽玲译97
    91引言98
    92Spanscript方法学99
    93用于微阵列芯片的3′ cDNA文库(探针库)制备102
    94Spanscript技术应用实例102
    95基本原理103
    96Spanscript软件104
    97讨论105
    参考文献107
    10生物芯片数据管理陆祖宏刘全俊潘品良译108
    101引言109
    102微阵列数据库的分析模块110
    103微阵列数据分析中的噪声采样115
    104数据共享和查询120
    105微阵列芯片实验室信息管理系统121
    106GeneDirector自定义121
    107总结121
    参考文献122
    11用LFC模型从芯片数据中鉴定差异表达基因仇华吉李娜译123
    111引言124
    112将LFC模型应用于实验数据集125
    113结论129
    参考文献130
    12应用50mer寡核苷酸芯片分析线虫基因表达高志贤张蕾刘楠译
    陈忠斌校131
    121引言132
    122结果133
    123讨论142
    124方法144
    致谢146
    参考文献146
    13生物芯片技术检测大鼠体内**诱导氧化酶P450 mRNA及其他**代谢
    相关基因表达水平:在**筛选与开发中的应用马卓娅汤华译
    陈忠斌校148
    131引言149
    132材料和方法149
    133结果151
    134讨论154
    致谢158
    参考文献158
    14寡核苷酸芯片技术在突变分析中的开发与应用文思远王升启译159
    141引言160
    142寡核苷酸制备161
    143点样过程163
    144样品制备165
    145杂交和洗涤169
    146芯片扫描和数据分析171
    致谢172
    参考文献172
    15生物芯片技术比较、统计分析和实验设计付俊杰苏震译174
    151引言175
    152芯片基因表达平台175
    153芯片偏差的统计分析178
    154偏差来源179
    155统计学定义179
    156芯片功效分析181
    157跨平台数据185
    158样点形态185
    159功能质量控制187
    1510芯片质量控制:对照探针188
    1511芯片质量控制:检测探针190
    1512应用CodeLink Mouse Uniset Ⅰ芯片的生物实验190
    1513公共基因表达数据193
    1514可供搜索的公共基因表达数据库和通用数据格式193
    1515基因表达谱:差减杂交与微阵列芯片194
    1516讨论196
    参考文献208
    16INFINITITM系统:临床实验室的自动化多功能芯片平台
    周华蕾姚站馨吕茂民译章金刚校212
    161引言213
    162BioFilmChipTM微阵列芯片214
    163INFINITITM分析仪215
    164QmaticTM操作软件216
    165IntellipacTM试剂管理模块217
    166INFINITITM系统的应用实例:实验过程及结果分析218
    167结论220
    致谢220
    参考文献221
    附录Ⅰ高志贤张蕾刘楠译陈忠斌校222
    1RNA的分离222
    2荧光标记靶基因225
    3分光光度法定量检测Cydye标记的靶标231
    4用Amersham GENⅢ Microarrayer在氨基硅烷玻片上点制微阵列芯片232
    5芯片手工杂交操作程序233
    6芯片扫描234
    附录Ⅱ高志贤张蕾刘楠译陈忠斌校235
    1 寡核苷酸探针与扩增子探针235
    2 芯片表面235

    与描述相符

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