《华佗神方》亦名《华佗神医秘传》，原题“古代真本”，“汉。谯县华佗元化撰、唐·华原孙思邈编集”，本书是根据中华民国十二年、古书保存会藏版、上海大陆图书公司排版的“海内真本”《华佗神医秘传》整理点校。
全书共二十二卷，涉及到病理、诊断、临症、炼药、养性服饵以及内科、外科、妇科、产科、儿科、耳科、鼻科、眼科、齿科、喉科、皮肤科、伤科、结毒科、急救科、治奇症、兽医科等各种常见病症的证治与方药，并有经验秘方，累计1103方。其用药简便廉验，功于实用，实为一部简便实用的中医临症方书。

卷一华佗论病理神方
一○○一 论人法与天地
一○○二 论阴阳大要
一○○三 论生成
一○○四 论阳厥
一○○五 论阴厥
一○○六 论阴阳痞格
一○○七 论寒热
一○○八 论虚实大要
一○○九 论上下不宁
一○一○ 论脉要
一○一一 论五色脉
一○一二 论脉病外内证诀
一○一三 论生死大要
一○一四 论病有灾怪
一○一五 论水法
一○一六 论火法
一○一七 论风中有五生五死
一○一八 论积聚癥瘕杂虫
一○一九 论劳伤
一○二○ 论传尸
一○二一 论肝脏虚实寒热生死逆顺脉证之法
一○二二 论心脏虚实寒热生死逆顺脉证之法
一○二三 论脾虚实寒热生死逆顺脉证之法
一○二四 论肺脏虚实寒热生死逆顺脉证之法
一○二五 论肾脏虚买寒热生死逆顺脉证之法
一○二六 论胆虚实寒热生死逆顺脉证之法
一○二七 论小肠虚实寒热生死逆顺脉证之法
一○二八 论胃虚实寒热生死逆顺脉证之法
一○二九 论大肠虚实寒热生死逆顺脉证之法
一○三○ 论膀胱虚实寒热生死逆顺脉证之法
一○三一 论三焦虚实寒热生死逆顺脉证之法
一○三二 论痹
一○三三 论气痹
一○三四 论血痹
一○三五 论肉痹
一○三六 论筋痹
一○三七 论骨痹
一○三八 论治中风偏枯之法
一○三九 论五疔状候
一○四○ 论痈疮
一○四一 论脚弱状候不同
一○四二 论水肿生死脉证
一○四三 论淋沥小便不利
一○四四 论古今药饵得失
一○四五 论三痞
一○四六 论各种疗治法宜因病而施
一○四七 论诊杂病必死脉候
一○四八 论察声色形证决死法
卷二 华佗临症神方
一○○一 华佗治头痛身热要诀
二○○二 华佗治肢烦口干要诀
二○○三 华佗治牙痛要诀
二○○四 华佗治死胎要诀
二○○五 华佗治矢镞入骨要诀
二○○六 华佗治膝疮要诀
二○○七 华佗治湿浊上升要诀
二○○八 华佗治寒热要诀
二○○九 华佗治腹痛脾腐要诀
二○一○ 华佗治脚病要诀
二○一一 华佗治酒毒要诀
二○一二 华佗治虚损要诀
二○一三 华佗治胃管要诀
二○一四 华佗治婴儿下痢要诀
二○一五 华佗治虿螫要诀
二○一六 华佗治急症要诀
二○一七 华佗治头风要诀
二○一八 华佗治血郁要诀
二○一九 华佗治病笃要诀
二○二○ 华佗治咽塞要诀
二○二一 华佗治内疽要诀
二○二二 华佗治欲产不通要诀
二○二三 华佗治咳嗽要诀
二○二四 华佗治血脉诸病要诀
二○二五 华佗治腹背诸疾要诀
二○二六 华佗治脏腑痈疡要诀
二○二七 华佗治精神衰颓要诀
二○二八 华佗治发白要诀
卷三 华佗神方秘方
卷四 华佗内科神方
卷五 华佗外科神方
卷六 华佗妇科神方
卷七 华佗产科神方
卷八 华佗儿科神方
卷九 华佗眼科神方
卷十 华佗耳科神方
卷十一 华佗鼻科神方
卷十二 华佗齿科神方
卷十三 华佗喉科神方
卷十四 华佗皮肤科神方
卷十五 华佗伤科神方
卷十六 华佗结毒科神方
卷十七 华佗急救神方
卷十八 华佗治奇症法神方
卷十九 华佗兽医科神方
卷二十 华佗制炼诸药神方
卷二十一 华佗养性服饵法神方
卷二十二 华佗注仓公传附