本书是作者近年研究明清之际思想家方以智的论文合编。除引言外，十四篇文章大体分为四组：组讨论觉浪道盛、憨山德清和方学渐的学说，它们构成了方以智的师承、家学和思想背景。第二组集中处理《药地炮庄》，涉及到的问题包括该书的成书经过、解释特色以及在庄学史中的地位等。第三组主要说明方以智晚年的精神归宿、“公因反因”说在他思想中的地位等。后一组是对方以智第二子方中通怀念父亲的《哀述》诗的释读，也附带考辨了方以智与左锐的关系，末尾是一篇演讲记录。书名“异类中行”也是借自方中通的概括，它很恰当地诠释了方以智曲折复杂而又丰富多彩的一生。

方以智（1611-1671）是明末清初杰出的学者和思想家。他早年的实证研究，以及在此基础上对“通几”和“质测”关系的说明，曾被看作是明清学术转型的象征。他的“五行尊火”论、“公因反因”说，则被定位为传统元气论和辩证思维发展的新阶段。他的后期代表作《药地炮庄》，烹炮三教，归本大易，更被晚清学者誉为解《庄》书 。把这些内容综合起来看，方以智的思想和学术所达到的高度，与顾（炎武）、黄（宗羲）、王（夫之）相比，殊无愧色。这大概也是论者乐于把他们并称為明末清初四大家的原因所在 。不过，披读方氏著述，我们可以发现，上述数点其实都不是他个人的“孤明先发”。从其家学和师承中，我们可以找到大量的近似内容。就实证研究而言，方氏喜深考，受塾师王宣的影响。王是一位易学家，擅长以象数言物理。方以智曾经这样回忆道：“智十七八，即闻先生绪论。旷观千世，尝诗书歌咏间，引人闻道，深者征之象数。其所杂著，多言物理。” 他早年的作品《物理小识》，即是对老师工作（王宣著有《物理所》一书）的继承和模仿。 “通几”和“质测”的区别，见于方孔炤的《知言鉴》。此书虽然失传，但它的一段话却保存在《青原志略》中：“诂家沾懘，诐遁簧鼓久矣。曰宰理、物理、至理，曰公性、独性、习性，曰质测，曰通几，姑离合而陈之，乃可决耳。” 由这段话可以知道，“质测”“通几”二词并非由方以智所创发，他的父亲早已使用过同样的术语。 “公因反因”说，也是方孔炤的发明。《药地炮庄》卷一载有方以智自述的话，就是明证：“老父在鹿湖环中堂十年，《周易时论》凡三成矣。甲午之冬，寄示竹关。穷子展而读之，公因反因，真发千古所未发。” 方以智的第二个儿子方中通，则径称此说是他们方氏易学重要的贡献：“公因，一也。反因，二也。此方氏之易学，真破天荒。” 既是“方氏之易学”，那当然就不能看作方以智一人的功劳。

编 折中其间：方以智和他的家、师之学（代引言） 觉浪道盛师徒对《庄子》的定位 觉浪道盛的《论语》禅解 从《心学宗》看方学渐的学派归属问题 憨山《绪言》与老庄学 第二编 《药地炮庄》成书考 《药地炮庄》的解释特色 儒宗别传：方以智的庄学史观 由《药地炮庄》看方以智的惠施论 第三编 “公因反因”说在方以智思想中的地位 《青原志略》成书考 从《仁树楼别录》看方以智的晚年思想 方以智与左藏一 方中通《哀述》诗释读 附 录 异类中行——方以智晚年的精神归宿