《中华道藏》以明《正统道藏》、《万历续道藏》为底本,保持三洞四辅的基本框架,对三洞四辅以外的经文又根据不同的内容进行了相应的归类。全藏分为三洞真经、四辅真经、道教论集、道法众术、道教科仪、道史仙传和目录索引七大部类。各部类所收经书,按道派源流和时代先后编排次序。
《中华道藏》按现代人阅读习惯和图书整理规则进行编修,全藏分为两种体例,一为点校,即对保存完整的藏书加以新式标点并进行必要的校勘;二为合校和补缺,即在点校的基础上,对残缺的藏书以数种残卷相互校补,以合成完整的版本,同时增补了数十种原藏未收的明以前的道经。
《中华道藏》用繁体字重新录排,古体竖版,文字清晰,全藏分为四十九册,每册约100万字。全藏既有分册目录,又有总目录,并附目录索引、引用书目录索引、人名经名索引等,既符合现代规范,又有古书风骨,还能适应信息化发展的要求。在精装本的基础上,对校勘的一些内容进行修订后,推出线装珍藏版。